确实是这么个事实，比如四川大学华西医学院、中山大学中山医学院、华中科大学同济医学院及中南大学湘雅医学院等，医学专业的录取分在整个大学属于最高分。而北京大学医学部的分数却比北京大学其他专业分数要低一些。那到底是什么原因呢？
一、北京大学医学部并不是由北大自建，而是由北京医科大学合并而成的。
现在的北京大学医学部就是原来的北京医科大学，在2000年合并到北京大学。而北京大学毕竟是全国最顶尖两所大学之一，北京医科大学在合并前还是比北京大学低一个层次。北京医科大学合并前的录取分数比北京大学低十多二十分，尽管合并后，但北京大学医学部相对独立，但是在很多人目中还被看成一所医科大学。所以相对来说分数比北京大学其他本部专业要低一些。

二、北京大学医学部并不是最好医学类大学。
当然北京大学医学部合并前也是数一数二的医科大学，现在合并到北京大学后，更是沾北大的光，名气更上一层楼，录取分数也是涨了不少。但根据医学类大学排名，北京协和医学院排名更靠前，估计成绩更好的想学医学的同学，优先选择北京协和医学院了。从而导致北京大学医学部比北京大学其他本部专业要低一些。再说从学科来说，其实也有其他医学院的学科比北大医学部的更好，比如四川大学医学院的口腔医学专业。不是有同学放弃上北大、清华而选择四川大学的吗？

三、其他大学医学部录取分比其他专业分高，是因为本身合并前的医科大学不比大学名气差，而医学又是热门专业。
以中南大学为例，中南大学湘雅医学院在合并前是湖南医科大学，这是世界医学教育联合会（WFME）与国际医学教育专门委员会（IIME）在中国同时进行两个标准试点研究的两所院校之一。有着“北协和、南湘雅”美誉，中非常知名的医科大学，并不比中南大学前身的中南工业大学差。又由于医学是热门专业，也是第一批试办八年制医学教育的五所院校之一。所以中南大学湘雅医学院录取分数比其他专业分数更高。其他比如中山大学、四川大学也差不多是这样的情况。

不过随着北京大学的继续发展，北京大学医学部的录取分数不会一直低于北京大学其他大学，毕竟医学专业本身就是热门专业，又有北京大学的光环。估计以后会慢慢缩小跟北京大学其他的专业的差距。